تالاب بین‌المللی چغاخور و اراضي حاشيه آن، با مختصات جغرافيايي ۳۱ درجه و ۵۴ دقيقه تا ۳۱ درجه و ۵۶ دقيقه عرض شمالي و ۵۰ درجه و ۵۲ دقيقه تا ۵۰ درجه و ۵۶ دقیقه‌ی طول شرقي در قسمت شرق استان چهارمحال و بختياري و در ۶۰ کيلومتري جنوب شهرکرد (مركز استان) واقع گردیده است. حوضه آبريز اين تالاب بين عرض جغرافيايي ۳۱ درجه و ۵۰ دقيقه و ۴۸/۱۳ ثانيه تا ۳۱ درجه و ۵۷ دقيقه و ۱۴/۹ ثانيه عرض شمالي و طول ۵۰ درجه و ۴۸ دقيقه و ۲۵/۲۱ ثانيه تا ۵۰ درجه و ۵۷ دقيقه و ۱۲/۲۶ ثانيه طول شرقي و از شمال تا جنوب شرقي تالاب کشیده شده است. در يک نگاه کلي فرم توپوگرافي درياچه و اراضي اطراف آن به گونه‌اي است که چاله و دشت ميانه کوهي را ايجاد کرده و ارتفاعات بر آفتاب در شمال، شاپورناز در غرب و کلار در جنوب دورتادور آن را احاطه کرده‌اند. خط‌الرأس اين ارتفاعات حوضه‌ آبریز چغاخور را شکل می‌دهد. اين ارتفاعات در ناحيه کوهستاني زاگرس واقع گرديده و درنتیجه فعالیت‌های تکتونيکي شکل‌گرفته‌اند و تقریباً تمامي جهات اطراف درياچه را محاصره کرده‌اند.