با شکل گیری دبیرخانه های مدیریت زیست بومی در حوضه های دریاچه ارومیه، پریشان و شادگان تجهیز دبیرخانه ها همراه با آموزش نیروهای این دبیرخانه ها نیز در قالب کارگاه های آموزشی آغاز شد. زمانی که دبیرخانه های تالابی این سه سایت تالابی کاملا شکل گرفته و بر اساس شرح وظایف خود مشغول به فعالیت بودند، برای گسترش استفاده و به کارگیری رویکرد زیست بومی، هفت سایت تالابی جدید نیز برای تدوین برنامه مدیریت جامع انتخاب و با رایزنی های صورت گرفته دبیرخانه های این تالابها نیز در استانها شکل گرفته و تجهیز شدند.